Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp1Q8BJQ2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp1Q8BJQ2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp1Q8BJQ2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp1Q8BJQ2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms