Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ubash3bQ8BGG7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms