Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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H2-M10.6Q85ZW5 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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