Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Amigo1Q80ZD8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Amigo1Q80ZD8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Amigo1Q80ZD8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Amigo1Q80ZD8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Amigo1Q80ZD8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Amigo1Q80ZD8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Amigo1Q80ZD8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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