Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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NanogQ80Z64 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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NanogQ80Z64 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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NanogQ80Z64 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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NanogQ80Z64 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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NanogQ80Z64 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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NanogQ80Z64 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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NanogQ80Z64 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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NanogQ80Z64 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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NanogQ80Z64 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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NanogQ80Z64 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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NanogQ80Z64 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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NanogQ80Z64 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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NanogQ80Z64 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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