Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms