Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

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Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Arhgef17Q80U35 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Arhgef17Q80U35 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Arhgef17Q80U35 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Arhgef17Q80U35 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Arhgef17Q80U35 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Arhgef17Q80U35 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Arhgef17Q80U35 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Arhgef17Q80U35 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Arhgef17Q80U35 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Arhgef17Q80U35 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Arhgef17Q80U35 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Arhgef17Q80U35 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef17Q80U35 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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