Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Actn1Q7TPR4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Actn1Q7TPR4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Actn1Q7TPR4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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