Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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