Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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