Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Vstm2lQ6PDS0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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