Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim37Q6PCX9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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