Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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