Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp49Q6P9L4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp49Q6P9L4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp49Q6P9L4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp49Q6P9L4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp49Q6P9L4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp49Q6P9L4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp49Q6P9L4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp49Q6P9L4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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