Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms