Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh1Q6IUP1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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