Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tpm4Q6IRU2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tpm4Q6IRU2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tpm4Q6IRU2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tpm4Q6IRU2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tpm4Q6IRU2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tpm4Q6IRU2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tpm4Q6IRU2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tpm4Q6IRU2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tpm4Q6IRU2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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