Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Msl2Q69ZF8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Msl2Q69ZF8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Msl2Q69ZF8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msl2Q69ZF8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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