Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms