Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms