Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim24Q64127 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms