Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa17Q64016 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa17Q64016 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa17Q64016 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa17Q64016 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa17Q64016 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa17Q64016 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa17Q64016 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa17Q64016 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa17Q64016 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Defa17Q64016 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Defa17Q64016 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Defa17Q64016 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Defa17Q64016 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Defa17Q64016 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Defa17Q64016 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Defa17Q64016 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Defa17Q64016 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Defa17Q64016 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Defa17Q64016 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Defa17Q64016 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Defa17Q64016 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Defa17Q64016 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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