Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms