Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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BcanQ61361 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BcanQ61361 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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BcanQ61361 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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BcanQ61361 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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BcanQ61361 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms