Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Mre11Q61216 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Mre11Q61216 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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