Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms