Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms