Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms