Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms