Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms