Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms