Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TefmQ5SSK3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TefmQ5SSK3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TefmQ5SSK3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TefmQ5SSK3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TefmQ5SSK3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TefmQ5SSK3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TefmQ5SSK3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TefmQ5SSK3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms