Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rbm27Q5SFM8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rbm27Q5SFM8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rbm27Q5SFM8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rbm27Q5SFM8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rbm27Q5SFM8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rbm27Q5SFM8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rbm27Q5SFM8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rbm27Q5SFM8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rbm27Q5SFM8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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