Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ecm2Q5FW85 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms