Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf354cQ571J5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms