Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms