Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm29609Q3UU56 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm29609Q3UU56 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm29609Q3UU56 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm29609Q3UU56 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm29609Q3UU56 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm29609Q3UU56 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm29609Q3UU56 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm29609Q3UU56 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm29609Q3UU56 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm29609Q3UU56 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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