Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms