Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms