Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp19Q3UJD6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms