Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U595 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U595 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U595 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U595 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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