Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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