Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms