Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm38051-201ENSMUST00000193740 433 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Pudp-201ENSMUST00000056460 1044 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm6348-201ENSMUST00000200751 1443 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm6468-201ENSMUST00000201076 1443 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm6346-201ENSMUST00000201146 1443 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam117bQ3U3E2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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