Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Rnf149Q3U2C5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Rnf149Q3U2C5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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