Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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