Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms