Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccndbp1Q3TVC7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccndbp1Q3TVC7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccndbp1Q3TVC7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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