Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Calr4Q3TQS0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Calr4Q3TQS0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Calr4Q3TQS0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Calr4Q3TQS0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Calr4Q3TQS0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Calr4Q3TQS0 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Calr4Q3TQS0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Calr4Q3TQS0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Calr4Q3TQS0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Calr4Q3TQS0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calr4Q3TQS0 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms