Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gtf3c3Q3TMP1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gtf3c3Q3TMP1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gtf3c3Q3TMP1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gtf3c3Q3TMP1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gtf3c3Q3TMP1 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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